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Chroma滤光片在荧光原位杂交中的应用

作者: 时间:2023-08-18

荧光原位杂交(Fluorescence In Situ Hybridization, FISH)是指利用荧光染料做标记,已知序列的单链核酸作为探针,通过碱基互补配对原则,与待检样品中核酸进行特异性结合,然后通过观察荧光信号,从而对样品中待检核酸进行定性,定量及定位分析。FISH具有快速,信号强,特异性高以及可以多重染色等特点,广泛应用与产前诊断,基因组结构分析等领域。

影响FISH结果的因素有很多,其中包括样品准备和处理,显微镜,光源,荧光探针以及滤光片FISH通常基于荧光显微镜来观测信号,利用滤光片包括激发片,二向色镜和发散片三种。其工作原理如下图所示:


-激发片:选择透过光源某部分波段的光,用来激发荧光探针;

-二向色镜:反射光源的光至样品,透过产生的荧光并反射激发光的散射光;

-发散片:选择透过荧光的某部分波段的光至检测器或人眼,并完全阻挡掉激发光的杂散光。

FISH实验中,滤光片带宽的大小会对FISH图像的对比度产生重要的影响。增加带宽会提高激发和接收效率,使接收的信号增强。但实际接收的信号中同时包含了探针的荧光信号和样品的背底噪音,带宽的增加会同时增加这两者的强度。带宽减小,虽然可以降低背底噪音的强度,但荧光信号也会随之减弱。所以对于对比度要求很高的FISH实验,针对于每种具体的染料,都会存在一个最佳的带宽,使FISH图像能够达到最佳的对比度。Chroma滤光片在荧光原位杂交中的应用源自于Chroma FISH滤光片的带宽都是根据常用的FISH染料做过优化可以为用户的FISH实验提供最佳的图像对比度。

如图所示:B的信号比A91%,但是B的噪音比A226%A具有更好的对比度!


Chroma FISH滤光片组具有以下特点:

-高透过率、高截止深度和高光谱陡度;

-保证足够亮度的同时,提供最佳的图像对比度;

-消除串色的影响;

a. 消除GoldAqua串色到Green通道;

b. 消除GoldOrange串色到Red通道;

-对多波段滤光片组中的DAPI通道进行特殊处理,避免DAPI信号过强而将其他通道信号掩盖;

-多色图像叠加零漂移;

-磁控溅射镀膜,终身质保。

ET系列—FISH单波段带通滤光片组

滤光片组

激发片CWL/FWHM

二向色镜50% cut-on

发散片CWL/FWHM

FISH探针

备注

49000

350/50

400

460/50

DAPI

49028

395/25

425

460/50

DAPI

用于395nm光源

49301

405/10

425

460/36

Blue

49302

436/20

455

480/30

Aqua

49303

495/25

515

537/29

Green

用于有Aqua,无Gold

49308

485/25

505

525/30

Green

用于无Aqua,有Gold

49312

490/20

505

525/20

Green

用于有Aqua,有Gold

49304

546/10

556

572/23

Gold

49305

546/22

565

590/30

Orange

用于无Red

49309

539/21

556

576/31

Orange

用于有Red

49306

580/20

600

625/30

Red

用于无Gold,无Orange

49310

592/21

610

630/30

Red

用于有Gold,无Orange

49311

599/13

612

632/28

Red

用于有Orange

49307

630/20

647

667/30

Far Red

49009

630/30

660

690/50

Far Red

ET系列—FISH多波段滤光片组:

DAPI是一种能够与DNA双链特异性结合的有机荧光染料。在FISH实验中,DAPI主要用来对整个细胞核进行染色成像,这就导致了DAPI的浓度要远高于其他FISH探针的浓度。而在有些FISH实验流程中,DAPI是在最后一步进行染色,染色之后也没有清洗的步骤。

在使用多波段滤光片进行多色FISH实验中,为了避免DAPI的信号将其他FISH探针的信号掩盖,在Chroma的多波段滤光片组中,会刻意降低激发片在DAPI处的透过率,从保证DAPI的信号不至于过高。

DAPI和Aqua的发射峰高度重叠,通常情况下同时做两种探针的成像会很困难,因为大量的DAPI信号会将Aqua 信号掩盖掉。


Chroma滤光片在荧光原位杂交中的应用:

Chroma69014滤光片组,通过降低DAPI的激发效率。能够实现DAPIAquaGreenOrange四色的同时观察。DAPlAqua采用不同的激发波段,但共享同一个接收通道。




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